Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB1P54762 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB1P54762 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms