Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YARSP54577 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YARSP54577 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YARSP54577 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YARSP54577 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YARSP54577 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YARSP54577 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YARSP54577 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YARSP54577 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YARSP54577 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YARSP54577 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YARSP54577 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YARSP54577 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YARSP54577 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YARSP54577 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YARSP54577 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YARSP54577 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YARSP54577 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YARSP54577 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YARSP54577 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YARSP54577 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YARSP54577 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YARSP54577 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YARSP54577 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YARSP54577 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YARSP54577 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YARSP54577 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YARSP54577 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YARSP54577 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YARSP54577 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms