Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACLYP53396 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ACLYP53396 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACLYP53396 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACLYP53396 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACLYP53396 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ACLYP53396 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACLYP53396 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACLYP53396 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACLYP53396 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACLYP53396 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACLYP53396 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACLYP53396 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACLYP53396 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ACLYP53396 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACLYP53396 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ACLYP53396 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACLYP53396 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACLYP53396 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACLYP53396 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACLYP53396 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACLYP53396 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACLYP53396 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ACLYP53396 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ACLYP53396 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACLYP53396 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACLYP53396 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACLYP53396 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACLYP53396 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACLYP53396 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ACLYP53396 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACLYP53396 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACLYP53396 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACLYP53396 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms