Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAV2P52735 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV2P52735 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV2P52735 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV2P52735 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAV2P52735 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV2P52735 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV2P52735 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV2P52735 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV2P52735 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAV2P52735 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV2P52735 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV2P52735 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAV2P52735 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAV2P52735 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAV2P52735 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV2P52735 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV2P52735 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV2P52735 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAV2P52735 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV2P52735 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV2P52735 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV2P52735 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV2P52735 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV2P52735 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV2P52735 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV2P52735 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV2P52735 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV2P52735 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV2P52735 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV2P52735 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms