Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLK3P49761 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK3P49761 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK3P49761 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK3P49761 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK3P49761 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK3P49761 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLK3P49761 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLK3P49761 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK3P49761 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLK3P49761 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLK3P49761 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK3P49761 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK3P49761 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK3P49761 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK3P49761 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLK3P49761 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLK3P49761 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLK3P49761 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK3P49761 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK3P49761 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK3P49761 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLK3P49761 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLK3P49761 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLK3P49761 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms