Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB3P49720 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms