Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARSP49589 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARSP49589 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARSP49589 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARSP49589 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARSP49589 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARSP49589 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARSP49589 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARSP49589 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARSP49589 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARSP49589 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARSP49589 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARSP49589 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARSP49589 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARSP49589 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARSP49589 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARSP49589 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARSP49589 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARSP49589 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARSP49589 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARSP49589 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARSP49589 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARSP49589 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARSP49589 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARSP49589 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARSP49589 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARSP49589 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARSP49589 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARSP49589 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARSP49589 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARSP49589 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARSP49589 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARSP49589 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARSP49589 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms