Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTBP49356 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTBP49356 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTBP49356 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTBP49356 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTBP49356 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTBP49356 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTBP49356 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTBP49356 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTBP49356 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTBP49356 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTBP49356 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTBP49356 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTBP49356 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTBP49356 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTBP49356 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTBP49356 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNTBP49356 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTBP49356 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTBP49356 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTBP49356 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTBP49356 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTBP49356 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTBP49356 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTBP49356 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTBP49356 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTBP49356 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTBP49356 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTBP49356 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTBP49356 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTBP49356 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTBP49356 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTBP49356 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTBP49356 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTBP49356 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTBP49356 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTBP49356 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTBP49356 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTBP49356 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTBP49356 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms