Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT5P48643 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT5P48643 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT5P48643 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT5P48643 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT5P48643 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT5P48643 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT5P48643 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT5P48643 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT5P48643 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT5P48643 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT5P48643 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT5P48643 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT5P48643 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT5P48643 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT5P48643 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCT5P48643 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT5P48643 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT5P48643 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT5P48643 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT5P48643 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT5P48643 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT5P48643 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT5P48643 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT5P48643 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT5P48643 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT5P48643 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT5P48643 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCT5P48643 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCT5P48643 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT5P48643 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms