Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRIP1P48552 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRIP1P48552 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms