Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCP4P48539 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCP4P48539 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCP4P48539 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCP4P48539 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCP4P48539 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCP4P48539 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCP4P48539 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCP4P48539 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCP4P48539 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCP4P48539 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCP4P48539 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCP4P48539 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCP4P48539 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCP4P48539 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCP4P48539 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCP4P48539 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCP4P48539 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCP4P48539 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCP4P48539 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.5 ms