Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSSP48449 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSSP48449 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSSP48449 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSSP48449 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSSP48449 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSSP48449 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSSP48449 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSSP48449 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSSP48449 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSSP48449 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSSP48449 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LSSP48449 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSSP48449 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LSSP48449 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSSP48449 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSSP48449 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSSP48449 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSSP48449 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LSSP48449 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSSP48449 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSSP48449 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSSP48449 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSSP48449 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSSP48449 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSSP48449 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSSP48449 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSSP48449 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSSP48449 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSSP48449 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSSP48449 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSSP48449 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSSP48449 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSSP48449 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSSP48449 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSSP48449 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LSSP48449 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSSP48449 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSSP48449 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSSP48449 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms