Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRXP46100 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRXP46100 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRXP46100 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRXP46100 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRXP46100 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRXP46100 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRXP46100 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRXP46100 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRXP46100 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRXP46100 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRXP46100 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRXP46100 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRXP46100 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRXP46100 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRXP46100 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRXP46100 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRXP46100 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRXP46100 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRXP46100 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRXP46100 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRXP46100 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRXP46100 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRXP46100 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRXP46100 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRXP46100 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRXP46100 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRXP46100 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRXP46100 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRXP46100 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms