Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RECQLP46063 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RECQLP46063 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RECQLP46063 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RECQLP46063 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RECQLP46063 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RECQLP46063 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RECQLP46063 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RECQLP46063 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RECQLP46063 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RECQLP46063 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RECQLP46063 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RECQLP46063 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RECQLP46063 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RECQLP46063 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RECQLP46063 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RECQLP46063 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RECQLP46063 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RECQLP46063 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RECQLP46063 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RECQLP46063 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RECQLP46063 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RECQLP46063 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQLP46063 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQLP46063 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQLP46063 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RECQLP46063 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RECQLP46063 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RECQLP46063 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RECQLP46063 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQLP46063 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQLP46063 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQLP46063 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQLP46063 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RECQLP46063 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RECQLP46063 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms