Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSKP43235 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSKP43235 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSKP43235 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSKP43235 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSKP43235 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSKP43235 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSKP43235 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSKP43235 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSKP43235 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSKP43235 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSKP43235 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSKP43235 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSKP43235 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSKP43235 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSKP43235 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSKP43235 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSKP43235 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSKP43235 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSKP43235 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSKP43235 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSKP43235 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSKP43235 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSKP43235 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSKP43235 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSKP43235 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSKP43235 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSKP43235 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSKP43235 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSKP43235 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSKP43235 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSKP43235 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSKP43235 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSKP43235 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSKP43235 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSKP43235 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSKP43235 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSKP43235 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSKP43235 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSKP43235 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSKP43235 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSKP43235 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms