Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGFRP43088 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTGFRP43088 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms