Protein–RNA interactions for Protein: P40438

VTH1, VPS10 homolog 1, yeastyeast

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Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VTH1P40438 RCK1YGL158W 1539 nt7.33□□□□□ -1.24
VTH1P40438 ARF2YDL137W 546 nt7.33□□□□□ -1.24
VTH1P40438 BUD9YGR041W 1644 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 CTS1YLR286C 1689 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 HIR2YOR038C 2628 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 AVT4YNL101W 2142 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 YBL070CYBL070C 321 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 MRI1YPR118W 1236 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt7.31□□□□□ -1.24
VTH1P40438 EDC3YEL015W 1656 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 SPR6YER115C 576 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 THI5YFL058W 1023 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 THI12YNL332W 1023 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 ECM23YPL021W 564 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 ECM10YEL030W 1935 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 KTR5YNL029C 1569 nt7.3□□□□□ -1.24
VTH1P40438 CLB2YPR119W 1476 nt7.29□□□□□ -1.24
VTH1P40438 SSH4YKL124W 1740 nt7.29□□□□□ -1.24
VTH1P40438 PDC1YLR044C 1692 nt7.29□□□□□ -1.24
VTH1P40438 CIA2YHR122W 696 nt7.28□□□□□ -1.24
VTH1P40438 XPT1YJR133W 630 nt7.28□□□□□ -1.24
VTH1P40438 MTW1YAL034W-A 870 nt7.28□□□□□ -1.24
VTH1P40438 snR19snR19 568 nt7.28□□□□□ -1.24
VTH1P40438 FOX2YKR009C 2703 nt7.28□□□□□ -1.24
VTH1P40438 ESC8YOL017W 2145 nt7.28□□□□□ -1.24
VTH1P40438 AIF1YNR074C 1137 nt7.27□□□□□ -1.25
VTH1P40438 ETT1YOR051C 1239 nt7.27□□□□□ -1.25
VTH1P40438 MPM1YJL066C 759 nt7.27□□□□□ -1.25
VTH1P40438 STE50YCL032W 1041 nt7.27□□□□□ -1.25
VTH1P40438 ZUO1YGR285C 1302 nt7.26□□□□□ -1.25
VTH1P40438 GRS1YBR121C 2004 nt7.26□□□□□ -1.25
VTH1P40438 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.26□□□□□ -1.25
VTH1P40438 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.26□□□□□ -1.25
VTH1P40438 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.26□□□□□ -1.25
VTH1P40438 CEG1YGL130W 1380 nt7.24□□□□□ -1.25
VTH1P40438 EXO70YJL085W 1872 nt7.24□□□□□ -1.25
VTH1P40438 YJL107CYJL107C 1164 nt7.23□□□□□ -1.25
VTH1P40438 DCS2YOR173W 1062 nt7.23□□□□□ -1.25
VTH1P40438 SDA1YGR245C 2304 nt7.23□□□□□ -1.25
VTH1P40438 ACO1YLR304C 2337 nt7.23□□□□□ -1.25
VTH1P40438 FRT2YAL028W 1587 nt7.23□□□□□ -1.25
VTH1P40438 ADE3YGR204W 2841 nt7.23□□□□□ -1.25
VTH1P40438 AIR2YDL175C 1035 nt7.22□□□□□ -1.25
VTH1P40438 RFC2YJR068W 1062 nt7.22□□□□□ -1.25
VTH1P40438 NMD4YLR363C 657 nt7.22□□□□□ -1.25
VTH1P40438 SAP30YMR263W 606 nt7.22□□□□□ -1.25
VTH1P40438 ELC1YPL046C 300 nt7.22□□□□□ -1.25
VTH1P40438 UMP1YBR173C 447 nt7.22□□□□□ -1.25
VTH1P40438 RTC1YOL138C 4026 nt7.21□□□□□ -1.25
VTH1P40438 NOP58YOR310C 1536 nt7.21□□□□□ -1.25
VTH1P40438 GMC1YDR506C 1827 nt7.21□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YGR066CYGR066C 879 nt7.21□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YKR041WYKR041W 753 nt7.21□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YGP1YNL160W 1065 nt7.21□□□□□ -1.26
VTH1P40438 RAP1YNL216W 2484 nt7.21□□□□□ -1.26
VTH1P40438 SAC6YDR129C 1929 nt7.2□□□□□ -1.26
VTH1P40438 MSB3YNL293W 1902 nt7.2□□□□□ -1.26
VTH1P40438 ATR1YML116W 1629 nt7.2□□□□□ -1.26
VTH1P40438 FUM1YPL262W 1467 nt7.2□□□□□ -1.26
VTH1P40438 ALD3YMR169C 1521 nt7.19□□□□□ -1.26
VTH1P40438 ALD2YMR170C 1521 nt7.19□□□□□ -1.26
VTH1P40438 RIO1YOR119C 1455 nt7.19□□□□□ -1.26
VTH1P40438 RPT2YDL007W 1314 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 PDR18YNR070W 4002 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YGL088WYGL088W 366 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 SLZ1YNL196C 897 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 NPT1YOR209C 1290 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 RAT1YOR048C 3021 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 DAK1YML070W 1755 nt7.18□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt7.17□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YJR124CYJR124C 1347 nt7.17□□□□□ -1.26
VTH1P40438 MRM2YGL136C 963 nt7.17□□□□□ -1.26
VTH1P40438 IMA2YOL157C 1770 nt7.16□□□□□ -1.26
VTH1P40438 MTC5YDR128W 3447 nt7.16□□□□□ -1.26
VTH1P40438 RRP3YHR065C 1506 nt7.16□□□□□ -1.26
VTH1P40438 YDL012CYDL012C 324 nt7.16□□□□□ -1.26
VTH1P40438 SUT1YGL162W 900 nt7.16□□□□□ -1.26
VTH1P40438 BPL1YDL141W 2073 nt7.15□□□□□ -1.26
VTH1P40438 SSZ1YHR064C 1617 nt7.15□□□□□ -1.26
VTH1P40438 TRS23YDR246W 660 nt7.15□□□□□ -1.27
VTH1P40438 UBC8YEL012W 657 nt7.15□□□□□ -1.27
VTH1P40438 RFU1YLR073C 603 nt7.15□□□□□ -1.27
VTH1P40438 ECM30YLR436C 3825 nt7.14□□□□□ -1.27
VTH1P40438 POP3YNL282W 588 nt7.14□□□□□ -1.27
VTH1P40438 CLP1YOR250C 1338 nt7.14□□□□□ -1.27
VTH1P40438 DPH6YLR143W 2058 nt7.14□□□□□ -1.27
VTH1P40438 TBF1YPL128C 1689 nt7.13□□□□□ -1.27
VTH1P40438 IDP3YNL009W 1263 nt7.13□□□□□ -1.27
VTH1P40438 TIP41YPR040W 1071 nt7.13□□□□□ -1.27
VTH1P40438 MNN4YKL201C 3537 nt7.13□□□□□ -1.27
VTH1P40438 AMA1YGR225W 1782 nt7.13□□□□□ -1.27
VTH1P40438 YNL181WYNL181W 1224 nt7.12□□□□□ -1.27
VTH1P40438 YPL278CYPL278C 303 nt7.12□□□□□ -1.27
VTH1P40438 CUE2YKL090W 1332 nt7.12□□□□□ -1.27
VTH1P40438 RGD1YBR260C 2001 nt7.12□□□□□ -1.27
VTH1P40438 DPB4YDR121W 591 nt7.11□□□□□ -1.27
VTH1P40438 DBP8YHR169W 1296 nt7.11□□□□□ -1.27
VTH1P40438 PTK2YJR059W 2457 nt7.11□□□□□ -1.27
VTH1P40438 SUP56tL(CAA)A 82 nt7.1□□□□□ -1.27
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