Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPB2P35606 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COPB2P35606 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COPB2P35606 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COPB2P35606 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPB2P35606 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPB2P35606 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPB2P35606 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPB2P35606 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPB2P35606 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPB2P35606 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPB2P35606 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPB2P35606 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPB2P35606 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPB2P35606 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPB2P35606 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPB2P35606 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPB2P35606 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB2P35606 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB2P35606 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB2P35606 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB2P35606 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB2P35606 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB2P35606 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB2P35606 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB2P35606 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB2P35606 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB2P35606 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB2P35606 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB2P35606 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB2P35606 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB2P35606 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB2P35606 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB2P35606 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB2P35606 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB2P35606 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB2P35606 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPB2P35606 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPB2P35606 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPB2P35606 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
COPB2P35606 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB2P35606 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB2P35606 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB2P35606 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB2P35606 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB2P35606 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB2P35606 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB2P35606 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB2P35606 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB2P35606 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB2P35606 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB2P35606 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB2P35606 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms