Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTX2P32243 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX2P32243 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
OTX2P32243 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX2P32243 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX2P32243 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX2P32243 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX2P32243 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX2P32243 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX2P32243 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX2P32243 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTX2P32243 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTX2P32243 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX2P32243 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX2P32243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX2P32243 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms