Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC8P31273 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC8P31273 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXC8P31273 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms