Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSPOP30536 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSPOP30536 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSPOP30536 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSPOP30536 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSPOP30536 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSPOP30536 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSPOP30536 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSPOP30536 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSPOP30536 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSPOP30536 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSPOP30536 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSPOP30536 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSPOP30536 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSPOP30536 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSPOP30536 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TSPOP30536 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TSPOP30536 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TSPOP30536 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TSPOP30536 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSPOP30536 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSPOP30536 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TSPOP30536 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms