Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGA1P29973 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNGA1P29973 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms