Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCKSP29966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCKSP29966 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms