Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID4AP29374 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID4AP29374 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms