Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLD1P28340 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLD1P28340 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLD1P28340 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLD1P28340 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLD1P28340 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLD1P28340 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLD1P28340 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
POLD1P28340 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLD1P28340 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLD1P28340 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLD1P28340 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLD1P28340 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POLD1P28340 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLD1P28340 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLD1P28340 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLD1P28340 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLD1P28340 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
POLD1P28340 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLD1P28340 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLD1P28340 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLD1P28340 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLD1P28340 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLD1P28340 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLD1P28340 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLD1P28340 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLD1P28340 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLD1P28340 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLD1P28340 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
POLD1P28340 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLD1P28340 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLD1P28340 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLD1P28340 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLD1P28340 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLD1P28340 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLD1P28340 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLD1P28340 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD1P28340 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD1P28340 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD1P28340 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD1P28340 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLD1P28340 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLD1P28340 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLD1P28340 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLD1P28340 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
POLD1P28340 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLD1P28340 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms