Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CANXP27824 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CANXP27824 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CANXP27824 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CANXP27824 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CANXP27824 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CANXP27824 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CANXP27824 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CANXP27824 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CANXP27824 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CANXP27824 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CANXP27824 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CANXP27824 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CANXP27824 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CANXP27824 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CANXP27824 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CANXP27824 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CANXP27824 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CANXP27824 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CANXP27824 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CANXP27824 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CANXP27824 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CANXP27824 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CANXP27824 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CANXP27824 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CANXP27824 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CANXP27824 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CANXP27824 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CANXP27824 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CANXP27824 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CANXP27824 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CANXP27824 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CANXP27824 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CANXP27824 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CANXP27824 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CANXP27824 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CANXP27824 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CANXP27824 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CANXP27824 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CANXP27824 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CANXP27824 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CANXP27824 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CANXP27824 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CANXP27824 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CANXP27824 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CANXP27824 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CANXP27824 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CANXP27824 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CANXP27824 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CANXP27824 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CANXP27824 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CANXP27824 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CANXP27824 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CANXP27824 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CANXP27824 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CANXP27824 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CANXP27824 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CANXP27824 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CANXP27824 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms