Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTFP26441 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTFP26441 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTFP26441 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTFP26441 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTFP26441 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTFP26441 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTFP26441 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTFP26441 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTFP26441 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTFP26441 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTFP26441 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTFP26441 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTFP26441 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNTFP26441 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTFP26441 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTFP26441 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTFP26441 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTFP26441 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNTFP26441 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTFP26441 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CNTFP26441 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNTFP26441 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTFP26441 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms