Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMLP26374 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMLP26374 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMLP26374 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMLP26374 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHMLP26374 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMLP26374 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMLP26374 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMLP26374 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMLP26374 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMLP26374 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHMLP26374 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMLP26374 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMLP26374 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMLP26374 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMLP26374 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMLP26374 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMLP26374 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMLP26374 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMLP26374 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMLP26374 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMLP26374 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMLP26374 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMLP26374 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMLP26374 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMLP26374 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMLP26374 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMLP26374 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMLP26374 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMLP26374 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMLP26374 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMLP26374 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMLP26374 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMLP26374 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMLP26374 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMLP26374 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMLP26374 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHMLP26374 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMLP26374 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMLP26374 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMLP26374 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMLP26374 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMLP26374 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMLP26374 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms