Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN3P26045 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN3P26045 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN3P26045 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms