Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB7P26010 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB7P26010 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB7P26010 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms