Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKBIAP25963 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIAP25963 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIAP25963 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms