Protein–RNA interactions for Protein: P24666

ACP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACP1P24666 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACP1P24666 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACP1P24666 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACP1P24666 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACP1P24666 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACP1P24666 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACP1P24666 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACP1P24666 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACP1P24666 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACP1P24666 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACP1P24666 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACP1P24666 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACP1P24666 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACP1P24666 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACP1P24666 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACP1P24666 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACP1P24666 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACP1P24666 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACP1P24666 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACP1P24666 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACP1P24666 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms