Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP11P24347 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP11P24347 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP11P24347 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP11P24347 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP11P24347 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP11P24347 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP11P24347 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP11P24347 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP11P24347 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP11P24347 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP11P24347 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP11P24347 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP11P24347 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP11P24347 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP11P24347 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP11P24347 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP11P24347 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP11P24347 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP11P24347 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP11P24347 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms