Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KB1P23443 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KB1P23443 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms