Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR4P22455 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FGFR4P22455 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms