Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH3P22223 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH3P22223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH3P22223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH3P22223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH3P22223 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH3P22223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH3P22223 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH3P22223 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH3P22223 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH3P22223 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH3P22223 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH3P22223 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH3P22223 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH3P22223 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH3P22223 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH3P22223 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH3P22223 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH3P22223 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH3P22223 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH3P22223 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH3P22223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH3P22223 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms