Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCMT1P22061 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMT1P22061 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms