Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD247P20963 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD247P20963 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD247P20963 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD247P20963 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD247P20963 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD247P20963 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD247P20963 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD247P20963 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD247P20963 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD247P20963 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD247P20963 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD247P20963 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD247P20963 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD247P20963 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD247P20963 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD247P20963 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD247P20963 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD247P20963 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD247P20963 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD247P20963 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD247P20963 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD247P20963 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD247P20963 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD247P20963 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD247P20963 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD247P20963 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD247P20963 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD247P20963 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD247P20963 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD247P20963 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD247P20963 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD247P20963 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD247P20963 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD247P20963 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD247P20963 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD247P20963 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD247P20963 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CD247P20963 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD247P20963 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD247P20963 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD247P20963 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD247P20963 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD247P20963 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD247P20963 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms