Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN3P20807 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN3P20807 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms