Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKB1P19838 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKB1P19838 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKB1P19838 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms