Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFE3P19532 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFE3P19532 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFE3P19532 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFE3P19532 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFE3P19532 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFE3P19532 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFE3P19532 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFE3P19532 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFE3P19532 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFE3P19532 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFE3P19532 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFE3P19532 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFE3P19532 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFE3P19532 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFE3P19532 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFE3P19532 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFE3P19532 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFE3P19532 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFE3P19532 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFE3P19532 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFE3P19532 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms