Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XBP1P17861 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XBP1P17861 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XBP1P17861 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XBP1P17861 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XBP1P17861 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XBP1P17861 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XBP1P17861 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XBP1P17861 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XBP1P17861 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XBP1P17861 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XBP1P17861 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XBP1P17861 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XBP1P17861 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XBP1P17861 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XBP1P17861 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XBP1P17861 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XBP1P17861 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XBP1P17861 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XBP1P17861 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XBP1P17861 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XBP1P17861 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XBP1P17861 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XBP1P17861 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XBP1P17861 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XBP1P17861 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XBP1P17861 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XBP1P17861 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XBP1P17861 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms