Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB6P17509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB6P17509 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms