Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A2P16615 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A2P16615 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A2P16615 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms