Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF4P15884 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF4P15884 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF4P15884 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF4P15884 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF4P15884 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF4P15884 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF4P15884 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF4P15884 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF4P15884 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF4P15884 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF4P15884 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF4P15884 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF4P15884 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF4P15884 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF4P15884 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF4P15884 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF4P15884 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF4P15884 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF4P15884 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF4P15884 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF4P15884 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms