Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GSPT1P15170 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GSPT1P15170 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GSPT1P15170 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms