Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRAFP15056 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRAFP15056 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRAFP15056 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRAFP15056 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRAFP15056 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRAFP15056 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRAFP15056 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRAFP15056 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRAFP15056 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRAFP15056 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRAFP15056 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRAFP15056 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRAFP15056 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRAFP15056 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms