Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCP1P13796 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCP1P13796 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCP1P13796 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LCP1P13796 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCP1P13796 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LCP1P13796 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCP1P13796 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCP1P13796 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCP1P13796 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCP1P13796 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCP1P13796 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCP1P13796 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCP1P13796 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LCP1P13796 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCP1P13796 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCP1P13796 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LCP1P13796 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCP1P13796 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCP1P13796 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCP1P13796 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCP1P13796 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCP1P13796 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCP1P13796 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCP1P13796 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCP1P13796 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCP1P13796 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCP1P13796 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCP1P13796 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LCP1P13796 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCP1P13796 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCP1P13796 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCP1P13796 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCP1P13796 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCP1P13796 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCP1P13796 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCP1P13796 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCP1P13796 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.5 ms