Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA4P13612 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA4P13612 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA4P13612 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA4P13612 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms