Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CKBP12277 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKBP12277 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKBP12277 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKBP12277 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKBP12277 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CKBP12277 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CKBP12277 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKBP12277 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKBP12277 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKBP12277 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKBP12277 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKBP12277 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKBP12277 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKBP12277 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKBP12277 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKBP12277 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKBP12277 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKBP12277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKBP12277 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CKBP12277 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKBP12277 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKBP12277 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CKBP12277 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKBP12277 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKBP12277 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKBP12277 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKBP12277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKBP12277 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKBP12277 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKBP12277 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKBP12277 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKBP12277 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKBP12277 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKBP12277 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKBP12277 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKBP12277 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKBP12277 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CKBP12277 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKBP12277 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKBP12277 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKBP12277 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKBP12277 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKBP12277 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKBP12277 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKBP12277 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms